Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20518E9Q548 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm20518E9Q548 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20518E9Q548 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20518E9Q548 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20518E9Q548 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm20518E9Q548 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20518E9Q548 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20518E9Q548 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms