Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trip11E9Q512 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trip11E9Q512 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trip11E9Q512 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trip11E9Q512 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Trip11E9Q512 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trip11E9Q512 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Trip11E9Q512 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Trip11E9Q512 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trip11E9Q512 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Trip11E9Q512 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Trip11E9Q512 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trip11E9Q512 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trip11E9Q512 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trip11E9Q512 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip11E9Q512 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trip11E9Q512 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trip11E9Q512 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trip11E9Q512 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trip11E9Q512 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trip11E9Q512 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trip11E9Q512 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trip11E9Q512 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms