Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

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Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt90E9Q1Z0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt90E9Q1Z0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Krt90E9Q1Z0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt90E9Q1Z0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt90E9Q1Z0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt90E9Q1Z0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt90E9Q1Z0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt90E9Q1Z0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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