Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ryr1E9PZQ0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ryr1E9PZQ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ryr1E9PZQ0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ryr1E9PZQ0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ryr1E9PZQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ryr1E9PZQ0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ryr1E9PZQ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms