Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF0

Pcdh17, Protocadherin 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh17E9PXF0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh17E9PXF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh17E9PXF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh17E9PXF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdh17E9PXF0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh17E9PXF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdh17E9PXF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh17E9PXF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh17E9PXF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh17E9PXF0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdh17E9PXF0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh17E9PXF0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh17E9PXF0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh17E9PXF0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms