Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ2

1810011H11Rik, RIKEN cDNA 1810011H11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810011H11RikE9PVZ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
1810011H11RikE9PVZ2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1810011H11RikE9PVZ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1810011H11RikE9PVZ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
1810011H11RikE9PVZ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
1810011H11RikE9PVZ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
1810011H11RikE9PVZ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
1810011H11RikE9PVZ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1810011H11RikE9PVZ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1810011H11RikE9PVZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
1810011H11RikE9PVZ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1810011H11RikE9PVZ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms