Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4931429L15RikE9PVU2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931429L15RikE9PVU2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4931429L15RikE9PVU2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931429L15RikE9PVU2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4931429L15RikE9PVU2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4931429L15RikE9PVU2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4931429L15RikE9PVU2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4931429L15RikE9PVU2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4931429L15RikE9PVU2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931429L15RikE9PVU2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931429L15RikE9PVU2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931429L15RikE9PVU2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.7 ms