Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm9008E9PVG0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm9008E9PVG0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm9008E9PVG0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm9008E9PVG0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm9008E9PVG0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm9008E9PVG0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm9008E9PVG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms