Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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