Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcn1E9PVA8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gcn1E9PVA8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gcn1E9PVA8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gcn1E9PVA8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gcn1E9PVA8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gcn1E9PVA8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gcn1E9PVA8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gcn1E9PVA8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gcn1E9PVA8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms