Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ptrhd1D3Z4S3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ptrhd1D3Z4S3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ptrhd1D3Z4S3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ptrhd1D3Z4S3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ptrhd1D3Z4S3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ptrhd1D3Z4S3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ptrhd1D3Z4S3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms