Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc6D3YZP9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc6D3YZP9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc6D3YZP9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc6D3YZP9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccdc6D3YZP9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ccdc6D3YZP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ccdc6D3YZP9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ccdc6D3YZP9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ccdc6D3YZP9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ccdc6D3YZP9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc6D3YZP9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc6D3YZP9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc6D3YZP9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc6D3YZP9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc6D3YZP9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc6D3YZP9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc6D3YZP9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc6D3YZP9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc6D3YZP9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc6D3YZP9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc6D3YZP9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc6D3YZP9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc6D3YZP9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc6D3YZP9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc6D3YZP9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc6D3YZP9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc6D3YZP9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ccdc6D3YZP9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Ccdc6D3YZP9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.7 ms