Protein–RNA interactions for Protein: D3YWJ0

Nuggc, Nuclear GTPase SLIP-GC, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NuggcD3YWJ0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NuggcD3YWJ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NuggcD3YWJ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NuggcD3YWJ0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NuggcD3YWJ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NuggcD3YWJ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NuggcD3YWJ0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NuggcD3YWJ0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NuggcD3YWJ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NuggcD3YWJ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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