Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Loxhd1C8YR32 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Loxhd1C8YR32 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Loxhd1C8YR32 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Loxhd1C8YR32 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Loxhd1C8YR32 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Loxhd1C8YR32 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Loxhd1C8YR32 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Loxhd1C8YR32 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Loxhd1C8YR32 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Loxhd1C8YR32 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Loxhd1C8YR32 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Loxhd1C8YR32 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms