Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ppfia4B8QI36 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ppfia4B8QI36 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ppfia4B8QI36 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia4B8QI36 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia4B8QI36 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ppfia4B8QI36 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ppfia4B8QI36 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfia4B8QI36 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ppfia4B8QI36 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ppfia4B8QI36 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ppfia4B8QI36 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ppfia4B8QI36 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ppfia4B8QI36 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms