Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pnldc1B2RXZ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pnldc1B2RXZ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pnldc1B2RXZ1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pnldc1B2RXZ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pnldc1B2RXZ1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pnldc1B2RXZ1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pnldc1B2RXZ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pnldc1B2RXZ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnldc1B2RXZ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms