Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Phf3B2RQG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phf3B2RQG2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phf3B2RQG2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Phf3B2RQG2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Phf3B2RQG2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf3B2RQG2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf3B2RQG2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf3B2RQG2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf3B2RQG2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf3B2RQG2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf3B2RQG2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf3B2RQG2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf3B2RQG2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms