Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Col4a6B1AVK5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Col4a6B1AVK5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a6B1AVK5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a6B1AVK5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a6B1AVK5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Col4a6B1AVK5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Col4a6B1AVK5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Col4a6B1AVK5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col4a6B1AVK5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col4a6B1AVK5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col4a6B1AVK5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Col4a6B1AVK5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a6B1AVK5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col4a6B1AVK5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col4a6B1AVK5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Col4a6B1AVK5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col4a6B1AVK5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col4a6B1AVK5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms