Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef25A2ASI9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pramef25A2ASI9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pramef25A2ASI9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pramef25A2ASI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pramef25A2ASI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pramef25A2ASI9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pramef25A2ASI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms