Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itga8A2ARA8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itga8A2ARA8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itga8A2ARA8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Itga8A2ARA8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itga8A2ARA8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itga8A2ARA8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itga8A2ARA8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itga8A2ARA8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms