Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdccag3A2AIW0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdccag3A2AIW0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdccag3A2AIW0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdccag3A2AIW0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdccag3A2AIW0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdccag3A2AIW0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms