Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmem185aA2AF53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tmem185aA2AF53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tmem185aA2AF53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tmem185aA2AF53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem185aA2AF53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem185aA2AF53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem185aA2AF53 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem185aA2AF53 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms