Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDM2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YDM2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
A0A286YDM2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
A0A286YDM2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A286YDM2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A286YDM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A0A286YDM2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A286YDM2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A286YDM2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A286YDM2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms