Protein–RNA interactions for Protein: A0A1L1SQF0

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1L1SQF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A1L1SQF0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1L1SQF0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A0A1L1SQF0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1L1SQF0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1L1SQF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.52■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
A0A1L1SQF0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1L1SQF0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
A0A1L1SQF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
A0A1L1SQF0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1L1SQF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
A0A1L1SQF0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms