Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A0U1RNP2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
A0A0U1RNP2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
A0A0U1RNP2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
A0A0U1RNP2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A0A0U1RNP2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
A0A0U1RNP2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
A0A0U1RNP2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A0U1RNP2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
A0A0U1RNP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
A0A0U1RNP2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
A0A0U1RNP2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
A0A0U1RNP2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A0U1RNP2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A0U1RNP2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
A0A0U1RNP2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A0U1RNP2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
A0A0U1RNP2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms