Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn19Q9ET38 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn19Q9ET38 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn19Q9ET38 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms