Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ms4a4bQ9ES61 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ms4a4bQ9ES61 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms