Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vstm5Q9D806 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vstm5Q9D806 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms