Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms