Protein–RNA interactions for Protein: Q562D6

Trmo, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmoQ562D6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TrmoQ562D6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TrmoQ562D6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms