Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp444Q3TDV8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp444Q3TDV8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms