Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rom1P32958 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rom1P32958 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rom1P32958 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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