Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

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Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Herc1E9PZP8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Herc1E9PZP8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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