Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Six6Q9QZ28 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Six6Q9QZ28 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms