Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtpbp4Q99ME9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtpbp4Q99ME9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms