Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sntg1Q925E1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sntg1Q925E1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms