Protein–RNA interactions for Protein: Q80W69

Uncharacterized protein C12orf71 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80W69 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q80W69 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q80W69 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q80W69 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Q80W69 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q80W69 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q80W69 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms