Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRE5

Proser1, Proline and serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser1Q5PRE5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Proser1Q5PRE5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Proser1Q5PRE5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms