Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MitfQ08874 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MitfQ08874 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MitfQ08874 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms