Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GastP48757 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GastP48757 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GastP48757 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GastP48757 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GastP48757 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GastP48757 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GastP48757 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GastP48757 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GastP48757 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GastP48757 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GastP48757 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms