Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kif3aP28741 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kif3aP28741 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 594.5 ms