Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmb9P28076 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms