Protein–RNA interactions for Protein: V9GXQ2

Gm17087, Predicted gene 17087, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17087V9GXQ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17087V9GXQ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm17087V9GXQ2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm17087V9GXQ2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm17087V9GXQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm17087V9GXQ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17087V9GXQ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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