Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trpv2Q9WTR1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trpv2Q9WTR1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms