Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ptpn13Q64512 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ptpn13Q64512 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms