Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc10Q3TLI0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trappc10Q3TLI0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trappc10Q3TLI0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms