Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Defa11P50709 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Defa11P50709 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms