Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Capza1P47753 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capza1P47753 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms