Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Psmb9P28076 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmb9P28076 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms