Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf1aP25118 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tnfrsf1aP25118 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms