Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb10O35955 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb10O35955 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms